Réponse:
1) Mozart had not composed any operas when he first came to France.
2) When his daughter died, Hugo had not written Les Misérables yet.
3) By the time we got home, the thief had left.
Explications:
Il faut identifier l'action la plus ancienne de l'action la plus récente :
Le temps qu'on rentre à la maison, le voleur était (déjà) parti.
L'action la plus ancienne concerne le voleur car il était parti avant qu'on ne rentre à la maison. On va donc conjuguer l'action la plus ancienne au past perfect et la moins ancienne au prétérit.
Si tu as besoin d'explications n'hésite pas ! ;)
Bon après-midi à toi